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文章發(fā)表 | 基于蛋白組學(xué)模型預(yù)測(cè) EGFR 突變肺腺癌患者術(shù)后腦轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)
發(fā)布時(shí)間:2024-05-17

近日隧帜,廣州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院楊海虹教授團(tuán)隊(duì)聯(lián)合天津市臨床多組學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室在 International Journal of Medical Sciences 上發(fā)表了一篇題為“Proteomics-based Model for Predicting the Risk of Brain Metastasis in Patients with Resected Lung Adenocarcinoma carrying the EGFR Mutation”的文章铡暂,基于液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(LC-MS/MS)技術(shù)構(gòu)建了一種蛋白質(zhì)標(biāo)志物預(yù)測(cè)模型來精確預(yù)測(cè)攜帶 EGFR 突變的肺腺癌患者術(shù)后腦轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn),對(duì)于臨床初次手術(shù)后患者的個(gè)體化精準(zhǔn)治療具有重要意義豫柿。


腦轉(zhuǎn)移(BMs)是 EGFR 突變肺腺癌患者的常見并發(fā)癥倡油,發(fā)生率高且與不良預(yù)后密切相關(guān)。辨別腦轉(zhuǎn)移高危人群并進(jìn)行有效干預(yù)對(duì)于減少或延緩 BM 的發(fā)生具有重要意義剧灰。目前尚缺乏有效的工具評(píng)估栓栋,鑒于 BM 的高發(fā)病率,迫切需要開發(fā)新的生物標(biāo)志物匣吊。


|研究方法|


對(duì) 2012 至 2018 年間廣州醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院招募的 56 名受試者進(jìn)行回顧性分析儒拂,所有患者均為攜帶 EGFR 突變、經(jīng)根治性切除后復(fù)發(fā)的肺腺癌(LUAD)患者色鸳。將患者分為腦轉(zhuǎn)移組(BM社痛,n=28)和非腦轉(zhuǎn)移組(NBM,n=28)缕碎,利用 LC-MS/MS 技術(shù)進(jìn)行組織蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)褥影。為了識(shí)別預(yù)測(cè) LUAD 腦轉(zhuǎn)移的潛在標(biāo)志物,對(duì)不同組別進(jìn)行比較分析咏雌,以評(píng)估與腦轉(zhuǎn)移相關(guān)的蛋白質(zhì)凡怎。


|研究結(jié)果|


研究顯示,復(fù)發(fā)患者的臨床因素與腦轉(zhuǎn)移發(fā)生之間沒有顯著相關(guān)性赊抖。在蛋白組學(xué)層面统倒,識(shí)別腦轉(zhuǎn)移組和非腦轉(zhuǎn)移組間的差異蛋白,篩選出區(qū)分兩組性能最優(yōu)的的 8 種蛋白(RRS1氛雪、CPT1A房匆、DNM1、SRCAP灶昏、MLYCD茬麻、PCID2、IMPAD1和FILIP1)言雀∧F基于隨機(jī)森林算法利用這八種蛋白構(gòu)建出最佳模型,其 ROC 值達(dá)到 0.9401刚哼,表明該模型在區(qū)分 BM 組和 NBM 組方面表現(xiàn)優(yōu)異啥读。


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進(jìn)一步分析腦轉(zhuǎn)移發(fā)生的潛在機(jī)制,對(duì)兩組差異蛋白進(jìn)行 GO 富集分析丹残,結(jié)果顯示 BM 組主要表現(xiàn)為參與脂質(zhì)代謝的蛋白上調(diào)然枫,而細(xì)胞周期通路相關(guān)蛋白表達(dá)下調(diào)夯饲。亞組分析顯示術(shù)后接受不同輔助治療方案的患者其蛋白特征差異顯著。接受化療的腦轉(zhuǎn)移患者雾诈,主要表現(xiàn)為參與染色體組裝撑雨、核相關(guān)通路蛋白顯著下調(diào),參與脂質(zhì)代謝和免疫相關(guān)通路蛋白上調(diào)脾婚。而接受 TKI 治療的腦轉(zhuǎn)移患者上調(diào)蛋白主要富集在與細(xì)胞黏附拐云、膜組織、炎癥反應(yīng)等膜改變相關(guān)通路近她,下調(diào)蛋白富集在與代謝物相關(guān)的通路上。


|研究結(jié)論|


本研究基于蛋白生物標(biāo)志物開發(fā)了一個(gè)可精準(zhǔn)預(yù)測(cè) EGFR 突變肺腺癌患者術(shù)后腦轉(zhuǎn)移風(fēng)險(xiǎn)的模型膳帕,對(duì)于患者術(shù)后管理具有重要的參考價(jià)值粘捎。




目前 LC-MS/MS 臨床檢驗(yàn)方法絕大多數(shù)是實(shí)驗(yàn)室自建方法,因?qū)嶒?yàn)室使用的儀器危彩、試劑攒磨、標(biāo)準(zhǔn)品等不同,需設(shè)置不同的檢測(cè)參數(shù)汤徽,導(dǎo)致自建的檢測(cè)方法存在很大差異娩缰,給 LC-MS/MS 檢測(cè)的標(biāo)準(zhǔn)化帶來很大困難。


譜天生物多款樣本前處理試劑盒的獲批谒府,解決了 LC-MS/MS 臨床檢驗(yàn)過程無標(biāo)準(zhǔn)拼坎、無質(zhì)控的弊端,極大程度改善不同實(shí)驗(yàn)室在使用質(zhì)譜檢測(cè)組織蛋白過程中遇到的以上障礙和可比性問題完疫,有助于進(jìn)一步改進(jìn) LC-MS/MS 方法在臨床上的應(yīng)用現(xiàn)狀泰鸡,加快實(shí)現(xiàn)蛋白質(zhì)組學(xué)的臨床轉(zhuǎn)化。


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代表產(chǎn)品


PT-L1TM  Ⅰ 期肺癌患者術(shù)后復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測(cè) 


ProteinT-Lung1TM (PT-L1TM)采用 LC-MS/MS 技術(shù)對(duì)患者腫瘤組織進(jìn)行蛋白質(zhì)組學(xué)檢測(cè)躯饿,基于模型計(jì)算患者復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)評(píng)分障翼,評(píng)估患者術(shù)后 5 年復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)。 PT-L1TM 的靈敏度和特異性高達(dá) 96% 和 86%犯弯,陰性預(yù)測(cè)值(NPV)高達(dá) 98%谚茅,可精準(zhǔn)地評(píng)估復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn),為患者帶來明確的臨床獲益意澡。

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